云南省阜外心血管病医院结构性心脏病中心是在医院开业元年成立的全新诊治中心，它高度顺应结构性心脏病的全新理念，有机整合心血管内科、外科、影像科的专业人员和技术优势，博取众长，高瞻远瞩，深入研究结构性心脏病的诊治，用心守护健康。

结构性心脏病中心目前开放床位45张，收治各类先心病、瓣膜病等心脏解剖结构异常性疾病。是一个以深度追求创伤小、风险低、并发症少、恢复快、住院时间短等为鲜明特点的技术创新型、人才复合型中心。介入治疗是中心的主要疾病治疗手段，可常规开展经皮房、室间隔缺损、动脉导管未闭、肺动脉瓣球囊扩张成型术等常见先心病介入治疗，亦可开展单纯超声引导下的先心病绿色封堵、经胸小切口先心病封堵、经皮主动脉瓣及二尖瓣狭窄球囊扩张（成型）术、左心耳封堵等新兴技术。并且在经导管主（肺）动脉瓣置换等热点领域处于全国领先水平。